در داخل عنبیه، ملانین (رنگدانه) ها وجود دارند، همان ماده ای که پوست را رنگ می کند. سلول های کوچک ملانین قهوه ای پر رنگ هستند. اگر تعداد آنها زیاد باشد، رنگ چشم ها قهوه ای سیر خواهد بود و برعکس کم بودن تعداد آنها باعث می شود که چشم ها قهوه ای کمرنگ باشند.
البته رنگ چشم نمی تواند به طور کامل سیاه باشد، اما دلیل آبی برخی چشم ها را می توان اینگونه توضیح داد: چشم هایی می توانند آبی باشند، که ملانین کمتری دارند. در این گونه چشم ها توده های کوچکی از ماده خاصی وجود دارند، که قابل رویت نیستند. آنها از هفت رنگ تشکیل دهنده نور سفید(قرمز- نارنجی- زرد- سبز- آبی- نیلی- بنفش) که دریافت می کنند، همه را جذب کرده، فقط آبی را پخش می کنند. پس رنگ آبی چشم، بازتاب ملانین هایی است که در عنبیه قرار دارند.
