بخور گرم باعث التهاب راه‌های هوایی می‌شود، این در حالیست که در بخور سرد چنین اتفاقی نمی‌افتد.
استفاده طولانی مدت بخورها به ویژه بخور گرم برای بیماران دارای آسم آلرژیک یا آلرژی بینی باعث رشد قارچ و تشدید آلرژی در آنها می‌شود.
بخور سرد برای اطفالی که اختلال التهابی نای دارند، بهتر است. در عین حال مصرف بخور گرم در اختلالات ریوی بهتر از بخور سرد است.
دستگاه بخور در هنگام استفاده باید در فاصله یک متری از بینی فرد قرار بگیرد.
دسترسی به دستگاه‌های بخور سرد کمتر و گران‌تر است، اما از بخور گرم در همه مکان‌ها و مراکز بیمارستانی استفاده می‌شود.
استفاده از بخورها را نباید ساده گرفت، انواع بخورها جنبه درمانی دارند و نباید بدون تجویز پزشک و به صورت مداوم توسط افراد در منزل مورد استفاده قرار بگیرند، چراکه می‌تواند مشکلاتی مانند رشد قارچ را به همراه داشته باشد.
