دستگاه بخور، یکبار مصرف نیست، بنابراین نگهداری آن اهمیت دارد. برای جلوگیری از رشد قارچ، باکتری و میکروب در آن، حتماً روزی یک بار آب مخزن دستگاه را عوض کنید و حداقل هفته ای دو بار کل دستگاه را با آب و مواد پاک کننده بشویید.
هرگز هر ماده ای را داخل مخزن آب دستگاه نریزید. برای اینکه دستگاه را از هر گونه باکتری، قارچ و کپک پاک کنید، بهتر است: آب داخل مخزن را هر روز خالی کنید و پس از خشک کردن، دوباره مقداری آب درون آن بریزید. هر سه روز یک بار دستگاه را از برق بکشید و املاح و جرم آب را پاک کنید. اگر دستگاه فیلتر دارد، هر چند وقت یک بار، فیلتر آن را عوض کنید. وقتی می خواهید دستگاه را برای مدتی کنار بگذارید، آب آن را خالی و دستگاه را تمیز کنید. دستگاه های مدل قدیمی را با مدل جدیدتر جایگزین کنید.