بهتر است جهت جلوگیری از خطا و بهم ریختن کد درون فایل catalina.sh یک فایل به نام setenv.sh برای لینوکس و setenv.bat برای ویندوز در پوشه bin در tomcat ایجاد نمود (در صورت عدم وجود این فایل ها) و تغیرات را در ان لحاظ کرد .
JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Xms128m -Xmx1024m -XX:PermSize=128m -XX:MaxPermSize=256m
-Djava.awt.headless=true -Dfile.encoding=utf-8 -server -XX:+DisableExplicitGC "