با استفاده از aspnet_regiis می توانید این کار را انجام دهید، برای این کار ابتدا نام کاربری و پسورد را در یک تگ جدا گانه در Web.config ذخیره کنید:
<secureAppSettings>
<add key="userName" value="yourUserName"/>
<add key="userPassword" value="yourPass"/>
</secureAppSettings>
سپس با استفاده از aspnet_regiis قسمت مورد نظر را encrypt کنید:
aspnet_regiis -pef secureAppSettings . -prov DataProtectionConfigurationProvider
اطلاعات بیشتر:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/dx0f3cf2%28v=vs.80%29.aspx
http://diablopup.blogspot.dk/2007/04/aspnetregiis-encryptdecrypt-webconfig.html