تنها راه پیشگیری از بیماری هموفیلی، جلوگیری از به دنیا آمدن فرزند مبتلا به این بیماری است. مردان مبتلا به هموفیلی بهتر است ازدواج نکنند. اگر هم اصرار به بچهدار شدن دارند باید حتما جنین را از نظر ژنتیک، جنس و احتمال ابتلا به بیماری تحتبررسی قرار دهند. درصورت وجود ژن هموفیلی در جنین میتوان او را در هفتههای اول با مجوز سیستمهای درمانی سقط و مجدد نسبت به بچهدار شدن اقدام کرد. شاید فرزند بعدی، ابتلای خفیفتری به هموفیلی داشته باشد. البته بحث در این زمینه بسیار وسیع است.
