با استفاده از Payara Micro می توان برنامه های Java EE را بدون نیاز به اجرای Application Server و با استفاده از command line اجرا کرد. Payara Micro بر پایه GlassFish 4.1 بنا شده (بصورت embed) و از Java EE 7 web profile پشتیبانی می کند و فایل های war را بصورت زیر می توان با استفاده از آن اجرا کرد:
java -jar payara-micro.jar --deploy test.war
Payara Micro بسیار سبک است و حدودا 60 مگابایت حجم دارد و قابلیت های جالبی مثل clustering خودکار دارد.